Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
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