Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.2 ms