Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
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