Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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TCOF1Q13428 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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TCOF1Q13428 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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TCOF1Q13428 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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TCOF1Q13428 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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TCOF1Q13428 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
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