Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
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