Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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