Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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PTP4A2Q12974 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
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PTP4A2Q12974 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
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PTP4A2Q12974 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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PTP4A2Q12974 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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PTP4A2Q12974 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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