Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
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LMOD1P29536 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
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LMOD1P29536 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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LMOD1P29536 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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LMOD1P29536 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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LMOD1P29536 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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LMOD1P29536 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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