Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
GTF2E1P29083 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.5 ms