Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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PTPRAP18433 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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PTPRAP18433 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
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PTPRAP18433 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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PTPRAP18433 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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PTPRAP18433 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
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