Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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