Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 NUCB1-AS1-201ENST00000416432 433 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL216P-201ENST00000471607 298 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP11-201ENST00000517018 287 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 MIR4428-201ENST00000584884 73 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 LINC01252-201ENST00000499291 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms