Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 SERPINB11-205ENST00000544088 1846 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
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