Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USF2Q15853 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
USF2Q15853 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USF2Q15853 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USF2Q15853 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
USF2Q15853 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USF2Q15853 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USF2Q15853 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USF2Q15853 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USF2Q15853 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USF2Q15853 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USF2Q15853 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USF2Q15853 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
USF2Q15853 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
USF2Q15853 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
USF2Q15853 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USF2Q15853 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
USF2Q15853 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
USF2Q15853 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
USF2Q15853 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
USF2Q15853 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
USF2Q15853 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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