Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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