Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 MAPK10-347ENST00000641762 2856 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.46□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 HEPH-209ENST00000519389 6013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 BTN3A2-205ENST00000508906 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 SIRPB1-205ENST00000381605 3241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 PSG9-204ENST00000418820 1748 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 TMEM246-203ENST00000374851 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 DMC1-203ENST00000428462 2082 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 RAPGEF5-201ENST00000344041 6621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 NUCB1-AS1-201ENST00000416432 433 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC074286.1-202ENST00000441205 567 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 RPS4XP21-201ENST00000603814 750 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 IL1RL1-203ENST00000404917 3571 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 ALG13-224ENST00000610588 4175 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 SMARCA2-252ENST00000636559 6853 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 SCN8A-201ENST00000354534 11556 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 IL1B-201ENST00000263341 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 MAPRE2-203ENST00000436190 4323 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 KIDINS220-206ENST00000473731 7248 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 KLHL32-207ENST00000620278 2642 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 ZC3H11A-203ENST00000367212 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 OR2AH1P-202ENST00000641232 2744 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 ZNF396-201ENST00000306346 2788 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 LRRC37B-220ENST00000584368 2773 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 OR2G6-203ENST00000641804 6084 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 NRXN3-201ENST00000281127 8504 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 EHHADH-201ENST00000231887 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 SEMA6A-210ENST00000510263 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 SPRY1-201ENST00000339241 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AL590762.1-201ENST00000391782 432 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC114752.2-201ENST00000424119 404 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 DCAF13P2-201ENST00000514188 555 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC025524.2-202ENST00000523042 535 ntTSL 4 BASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AP000435.1-201ENST00000528539 496 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
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