Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPS29P62273 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RPS29P62273 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
RPS29P62273 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPS29P62273 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RPS29P62273 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RPS29P62273 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RPS29P62273 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
RPS29P62273 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
RPS29P62273 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPS29P62273 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPS29P62273 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPS29P62273 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPS29P62273 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPS29P62273 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPS29P62273 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPS29P62273 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RPS29P62273 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPS29P62273 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPS29P62273 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RPS29P62273 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RPS29P62273 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPS29P62273 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPS29P62273 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RPS29P62273 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPS29P62273 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPS29P62273 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPS29P62273 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RPS29P62273 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPS29P62273 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RPS29P62273 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RPS29P62273 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RPS29P62273 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RPS29P62273 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RPS29P62273 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
RPS29P62273 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RPS29P62273 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPS29P62273 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPS29P62273 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPS29P62273 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPS29P62273 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPS29P62273 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPS29P62273 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
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