Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TTPAP49638 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TTPAP49638 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TTPAP49638 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TTPAP49638 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TTPAP49638 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TTPAP49638 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TTPAP49638 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TTPAP49638 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TTPAP49638 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TTPAP49638 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TTPAP49638 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TTPAP49638 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TTPAP49638 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TTPAP49638 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TTPAP49638 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TTPAP49638 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TTPAP49638 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TTPAP49638 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TTPAP49638 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TTPAP49638 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TTPAP49638 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TTPAP49638 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TTPAP49638 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TTPAP49638 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TTPAP49638 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TTPAP49638 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TTPAP49638 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TTPAP49638 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TTPAP49638 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TTPAP49638 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TTPAP49638 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TTPAP49638 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TTPAP49638 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TTPAP49638 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TTPAP49638 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TTPAP49638 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TTPAP49638 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TTPAP49638 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.77
TTPAP49638 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TTPAP49638 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TTPAP49638 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
TTPAP49638 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TTPAP49638 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
TTPAP49638 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TTPAP49638 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
TTPAP49638 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TTPAP49638 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TTPAP49638 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
TTPAP49638 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TTPAP49638 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TTPAP49638 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TTPAP49638 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TTPAP49638 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TTPAP49638 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TTPAP49638 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TTPAP49638 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TTPAP49638 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TTPAP49638 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TTPAP49638 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TTPAP49638 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TTPAP49638 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TTPAP49638 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TTPAP49638 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
TTPAP49638 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TTPAP49638 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TTPAP49638 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TTPAP49638 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TTPAP49638 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TTPAP49638 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TTPAP49638 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TTPAP49638 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
TTPAP49638 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
TTPAP49638 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TTPAP49638 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TTPAP49638 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TTPAP49638 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
TTPAP49638 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TTPAP49638 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TTPAP49638 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TTPAP49638 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TTPAP49638 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TTPAP49638 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TTPAP49638 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TTPAP49638 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TTPAP49638 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TTPAP49638 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TTPAP49638 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TTPAP49638 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TTPAP49638 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TTPAP49638 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TTPAP49638 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TTPAP49638 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TTPAP49638 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TTPAP49638 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TTPAP49638 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TTPAP49638 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TTPAP49638 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TTPAP49638 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TTPAP49638 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms