Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms