Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms