Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 IGSF6-201ENST00000268389 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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