Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 MEF2C-210ENST00000506554 3469 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 KLRD1-203ENST00000350274 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms