Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SRRTQ9BXP5 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms