Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms