Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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SEC23BQ15437 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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SEC23BQ15437 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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SEC23BQ15437 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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SEC23BQ15437 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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SEC23BQ15437 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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