Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
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PDCD1Q15116 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
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PDCD1Q15116 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
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