Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.9 ms