Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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