Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4AQ13619 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4AQ13619 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4AQ13619 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4AQ13619 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4AQ13619 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4AQ13619 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4AQ13619 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4AQ13619 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4AQ13619 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4AQ13619 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4AQ13619 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4AQ13619 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4AQ13619 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4AQ13619 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4AQ13619 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4AQ13619 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4AQ13619 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4AQ13619 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4AQ13619 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4AQ13619 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4AQ13619 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4AQ13619 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4AQ13619 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4AQ13619 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4AQ13619 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4AQ13619 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4AQ13619 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4AQ13619 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4AQ13619 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL4AQ13619 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
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