Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
EIF4EBP1Q13541 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
EIF4EBP1Q13541 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
EIF4EBP1Q13541 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
EIF4EBP1Q13541 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms