Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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