Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms