Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RPS29P62273 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RPS29P62273 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RPS29P62273 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RPS29P62273 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RPS29P62273 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RPS29P62273 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RPS29P62273 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RPS29P62273 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RPS29P62273 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
RPS29P62273 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RPS29P62273 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
RPS29P62273 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
RPS29P62273 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RPS29P62273 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
RPS29P62273 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
RPS29P62273 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPS29P62273 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms