Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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HOXD13P35453 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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HOXD13P35453 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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HOXD13P35453 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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HOXD13P35453 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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HOXD13P35453 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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HOXD13P35453 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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