Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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PKHD1P08F94 MGAM-208ENST00000549489 6525 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
PKHD1P08F94 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PKHD1P08F94 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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PKHD1P08F94 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
PKHD1P08F94 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
PKHD1P08F94 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
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PKHD1P08F94 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
PKHD1P08F94 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
PKHD1P08F94 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
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PKHD1P08F94 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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PKHD1P08F94 CD109-201ENST00000287097 9130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
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PKHD1P08F94 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
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PKHD1P08F94 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
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PKHD1P08F94 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PKHD1P08F94 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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PKHD1P08F94 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PKHD1P08F94 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PKHD1P08F94 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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PKHD1P08F94 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PKHD1P08F94 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
PKHD1P08F94 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PKHD1P08F94 TMEM2-205ENST00000377066 5217 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
PKHD1P08F94 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PKHD1P08F94 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PKHD1P08F94 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PKHD1P08F94 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PKHD1P08F94 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PKHD1P08F94 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
PKHD1P08F94 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PKHD1P08F94 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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