Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.3 ms