Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms