Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms