Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTZ2

USP17L1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L1Q7RTZ2 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 AC243571.1-201ENST00000615743 478 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP17L1Q7RTZ2 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.1 ms