Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 IGLV3-19-201ENST00000390309 377 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 GNAI2P2-201ENST00000417003 916 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL157401.1-201ENST00000419836 344 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC008074.2-201ENST00000425381 429 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL645936.2-201ENST00000430565 928 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 SNRPCP1-201ENST00000433292 458 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC011193.1-202ENST00000441287 323 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RN7SL218P-201ENST00000464637 299 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RN7SL379P-201ENST00000479912 293 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 TUBB3P2-201ENST00000480063 232 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RN7SL34P-201ENST00000497296 270 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC120193.1-204ENST00000519689 651 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC068831.6-201ENST00000560522 795 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC010650.1-201ENST00000567559 494 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC011468.2-202ENST00000594362 579 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 LINC01515-209ENST00000599409 755 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC019322.2-201ENST00000605634 147 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC107294.2-201ENST00000610001 701 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.45-201ENST00000620896 299 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 CTBP1-219ENST00000629223 210 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 LINC01646-202ENST00000634256 1107 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 FAM238A-202ENST00000637359 442 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 SNX16-202ENST00000353788 3032 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 CDH19-203ENST00000540086 1963 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 ZMYND11-204ENST00000381604 4066 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 PRYP4-201ENST00000306589 444 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 ZNF300P1-201ENST00000356555 1822 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP336-201ENST00000364189 117 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 CCDC181-201ENST00000367805 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 IGLC6-201ENST00000410078 317 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 YBX1P8-201ENST00000421881 943 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153 ms