Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
EXOSC2Q13868 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.8 ms