Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC7.8□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.8□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AL031123.3-201ENST00000623345 1837 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 TMED2-203ENST00000509052 1975 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms