Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FOXQ1Q9C009 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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