Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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SGCZQ96LD1 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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SGCZQ96LD1 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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SGCZQ96LD1 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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SGCZQ96LD1 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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SGCZQ96LD1 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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SGCZQ96LD1 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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SGCZQ96LD1 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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SGCZQ96LD1 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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