Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 CNNM2-202ENST00000369878 15857 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRIQ1Q96JM4 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.9 ms