Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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USP41Q3LFD5 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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USP41Q3LFD5 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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USP41Q3LFD5 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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USP41Q3LFD5 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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USP41Q3LFD5 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP41Q3LFD5 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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