Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms