Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
NRF1Q16656 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
NRF1Q16656 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
NRF1Q16656 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
NRF1Q16656 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
NRF1Q16656 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
NRF1Q16656 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
NRF1Q16656 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
NRF1Q16656 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms