Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 MYCBP2-201ENST00000357337 14736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 LRIG2-201ENST00000361127 11555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 RUNX1T1-205ENST00000436581 7454 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 MAS1-201ENST00000252660 9841 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 TLR4-201ENST00000355622 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 KIF1B-202ENST00000377081 8746 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 RAD54L2-201ENST00000409535 9776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 HNRNPA1P54-201ENST00000411857 9714 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 HYDIN-206ENST00000393567 15719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 COBLL1-203ENST00000392717 9523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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