Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
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